Seine-Maritime. Comment sont détectés les variants de la Covid-19 en laboratoire ?

Chaque test PCR positif à la Covid-19 donne désormais lieu à une autre analyse, afin de déterminer si un malade est infecté par un variant. "C'est devenu systématique, mais cela nécessite un kit spécifique pour mettre en évidence un variant", explique Guillaume Girault, docteur en biologie médicale au laboratoire Saint-Sever à Rouen.

Une détection obligatoire

Ces tests de criblage permettent de déterminer avec une forte probabilité une infection à un variant. "Pour être très précis, il faut avoir recours à une analyse de séquençage, poursuit Guillaume Girault. Mais ce procédé se fait dans des circonstances très précises, comme lors de clusters."

Le test de criblage est en quelque sorte plus simplifié, puisque son rôle est de détecter certaines mutations qui sont liées à des variants. "Pour le variant britannique, nous recherchons une mutation de la protéine Spike, dite mutation 69-71, tandis qu'une observation de la mutation 501 permet de confirmer la présence d'un variant qui peut être soit brésilien soit sud-africain, s'il n'y a pas de mutation 69-71", détaille le responsable du laboratoire Saint-Sever.

Une étape supplémentaire dans le travail du laboratoire, qui fait face à cette nouvelle obligation : "Ces tests de criblage peuvent parfaitement s'intégrer dans la routine, il faut simplement acheter les kits qui peuvent s'adapter à l'équipement." Dans ce laboratoire, associé à ceux de l'Europe et Flaubert à Rouen, ce sont environ la moitié les cas positifs qui sont désormais touchés par le variant britannique.

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